La Junta Directiva es el órgano de gobierno supremo del Instituto y entre sus atribuciones principales están:
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Establecer las políticas y lineamientos generales para el desarrollo de las actividades del Instituto.
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Aprobar el programa de actividades, plan de inversiones y proyecto de presupuesto anual de ingresos y egresos del Instituto.
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Aprobar la organización académica y administrativa del instituto y expedir los manuales correspondientes.
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Expedir los reglamentos que requiera la mejor organización y funcionamiento del Instituto.
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Aprobar las condiciones generales de trabajo del Instituto que someta a su consideración el Director General del mismo.
